Ο Φοιτητικός Σύλλογος υποστηρίζει αθλητικές, ψυχαγωγικές, καλλιτεχνικές, ακαδημαϊκές και άλλες δραστηριότητες μέσω των Φοιτητικών Ομάδων, οι οποίες λειτουργούν αυτόνομα. Στις Φοιτητικές Ομάδες μπορούν να συμμετέχουν όλοι οι προπτυχιακοί και μεταπτυχιακοί φοιτητές και φοιτήτριες του Τμήματος, ενώ παράλληλα δίνεται η δυνατότητα ίδρυσης νέων ομάδων. Σήμερα δραστηριοποιούνται οι ακόλουθες ομάδες:
- Όμιλος Παρατηρησιακής Αστρονομίας
- Χορευτική Ομάδα Παραδοσιακών Χορών
- Φοιτητικός Ραδιοφωνικός Σταθμός “Χώρος” 94,2 FM
- Ποδοσφαιρική Ομάδα – ΑΠΣΦ ΣΘΕ
- IEEE Aegean student branch